Hakkında
Türkiye Biyoçeşitlilik, Türkiye'de kaydedilmiş canlı türlerini açık veri kaynaklarından derleyerek Türkçe sunan bağımsız bir başvuru sitesidir. İlk bölüm mantarlardır; hayvanlar ve bitkiler hazırlanmaktadır.
Verinin kaynağı
Tür listesi ve kayıtlar GBIF'ten (Küresel Biyoçeşitlilik Bilgi Sistemi) alınır. GBIF; müzelerin, herbaryum ve fungaryumların, araştırma projelerinin ve iNaturalist gibi yurttaş bilimi platformlarının kayıtlarını ortak bir biçimde yayımlar. Sitede, ülke alanı Türkiye olan ve mantarlar âlemine (Fungi) ait 40 tür ile bu türleri içeren 88 üst takson yer alır. Sınıflandırma GBIF omurgasını (GBIF Backbone Taxonomy) izler; dünyadaki tür sayıları da bu omurgadaki kabul görmüş türlerdir.
Fiziksel kanıt ve çevresel DNA
Türkiye'deki mantar kayıtlarının büyük bölümü çevresel DNA (eDNA) çalışmalarından gelir: toprak, kök, su ya da hava örneklerinden çıkarılan DNA dizileri, başvuru veri tabanlarıyla karşılaştırılarak türlere atanır. Bu kayıtlar bir türün o ortamda bulunduğunu gösterir, ancak mantarın kendisi görülmemiş ya da toplanmamıştır; atama, başvuru dizilerinin doğruluğuna ve kapsamına bağlıdır.
Bu nedenle sitede kayıtlar iki gruba ayrılır ve her sayı, harita ve grafikte ayrı gösterilir:
- Fiziksel kanıt: insan gözlemi, korunmuş fungaryum ve herbaryum örneği, kültür koleksiyonundaki canlı örnek, yayın (literatür) kaydı ve diğer gözlem türleri.
- Çevresel DNA: GBIF'te kayıt temeli “materyal örneği” (MATERIAL_SAMPLE) olan kayıtlar.
Türlerin aylara göre dağılımı, rakım, il listeleri ve fotoğraflar yalnızca fiziksel kanıta dayanır. Haritalarda dolu noktalar fiziksel kayıtları, içi boş noktalar DNA örneklerini gösterir.
Sayılar nasıl hesaplanır
Kayıt sayıları, il, yıl ve ay dağılımları GBIF arama hizmetinin toplam sayımlarından alınır ve tüm kayıtları kapsar. Rakım, ilçe, habitat notu, toplayıcı ve gözlemci bilgileri ise her tür için ayrıntılı olarak indirilen en fazla 300 fiziksel kayda dayanır; çok kaydı olan türlerde bu bilgiler örneklem niteliğindedir. İl eşlemesi GBIF'in GADM sınırlarına göre yaptığı coğrafi kodlamayı izler. Üst taksonların sayıları, Türkiye'den kaydı bulunan türlerinin toplamıdır.
Şu anda toplam 13.967 kaydın 13.012'si çevresel DNA, 955'i fiziksel kanıt kaynaklıdır.
Türkçe adlar, görseller ve metinler
Türkçe adlar şu öncelikle seçilir: editörlerin kaynaklara dayanarak yazdığı içerik, kaynakları belirtilmiş Türkçe ad listesi ve Wikidata'daki Türkçe etiket ve yaygın adlar. Yöresel adlar bölgesi ve kaynağıyla birlikte gösterilir. Şu anda 2 türün Türkçe adı vardır; adı bilinmeyen türlerde yalnızca bilimsel ad kullanılır.
Görseller Wikimedia Commons'tan ve GBIF'e aktarılmış, açık lisanslı kayıt fotoğraflarından (çoğunlukla iNaturalist) alınır; her görselde fotoğrafçı, lisans ve kaynak bağlantısı belirtilir. 11 türün en az bir görseli vardır. Görseli olmayan taksonlarda bilimsel adın baş harfleri gösterilir.
Tür ve üst takson sayfalarındaki “Genel bakış” metinleri, editör içeriği bulunmayan sayfalarda verilerden otomatik olarak derlenir: her cümle bir veri alanına dayanır, veri yoksa cümle kurulmaz. Editör içeriği olan sayfalarda (28 sayfa) metin kaynakçasıyla birlikte verilir; denetimden geçmemiş metinler “Taslak” etiketi taşır. Vikipedi alıntıları (CC BY-SA) madde bağlantısıyla gösterilir; Türkçe madde yoksa İngilizce madde çevrilmeden ve açıkça belirtilerek verilir.
Morfoloji, ekoloji ve yenilebilirlik bilgileri Wikidata'daki mikomorfoloji özelliklerinden alınır ve Türkçeleştirilir; karşılığı bulunmayan değerler İngilizce özgün etiketiyle gösterilir.
Sınırlılıklar
- GBIF'teki kayıtlar Türkiye'nin mantar çeşitliliğinin yalnızca belgelenmiş bir bölümünü yansıtır. Bir türün bir ilde kaydının olmaması, orada bulunmadığı anlamına gelmez; kayıt yoğunluğu çoğunlukla gözlemci ve araştırma yoğunluğunu gösterir.
- Kayıtlardaki tür tanımları doğrulanmamış olabilir; özellikle yalnızca fotoğrafla yapılan gözlemlerde ve DNA atamalarında yanlış tanım olasılığı vardır.
- Taksonomi sürekli değişir. Sitede GBIF omurgasındaki kabul görmüş adlar kullanılır; güncel adlandırma için Index Fungorum ve MycoBank bağlantılarına bakılmalıdır.
- Otomatik derlenen metinler yalnızca verideki bilgiyi aktarır; türün biyolojisine ilişkin uzman değerlendirmesi yerine geçmez.
Yenilebilirlik uyarısı
Sitedeki yenilebilirlik bilgileri yalnızca bilgilendirme amaçlıdır. Bu siteye dayanarak hiçbir mantar toplanmamalı ya da yenmemelidir. Zehirlenme şüphesinde 114 Ulusal Zehir Danışma Merkezi'ni (UZEM) arayın. Ayrıntılar: Mantar zehirlenmeleri.
Veri setleri ve lisanslar
Kayıtların geldiği 53 GBIF veri seti aşağıda listelenmiştir. Veri setleri CC0, CC BY ya da CC BY-NC lisanslıdır; atıf için veri seti sayfasındaki DOI kullanılmalıdır. İl sınırları geoBoundaries (OpenStreetMap katkıcıları, CC BY-SA 2.0) verisinden sadeleştirilmiştir.
| Veri seti | Yayımlayan | Lisans | Kayıt |
|---|---|---|---|
| Global soil organismsdoi:10.15468/fdpeaw | PlutoF | CC0 1.0 | 11.205 |
| INSDC Host Organism Sequencesdoi:10.15468/e97kmy | European Nucleotide Archive (EMBL-EBI) | CC BY 4.0 | 1.042 |
| INSDC Sequencesdoi:10.15468/sbmztx | European Nucleotide Archive (EMBL-EBI) | CC BY 4.0 | 571 |
| iNaturalist Research-grade Observationsdoi:10.15468/ab3s5x | iNaturalist.org | CC BY-NC 4.0 | 456 |
| International Barcode of Life project (iBOL)doi:10.15468/inygc6 | The International Barcode of Life Consortium | CC BY 4.0 | 196 |
| CABI Bioscience Fungus Collectiondoi:10.15468/c9vdlf | CABI (Centre for Agriculture and Biosciences International) | CC BY 4.0 | 161 |
| Royal Botanic Gardens, Kew - Fungarium Specimensdoi:10.15468/ngrz4b | Royal Botanic Gardens, Kew | CC BY 4.0 | 119 |
| Global soil microbiomes: A new frontline of biome-ecology researchdoi:10.1111/geb.13487 | PlutoF | CC BY 4.0 | 43 |
| Global occurrence database of Leveillula taurica (Lév.) Arnaud 1921 (synonym: Erysiphe taurica Léveillé 1851, Phyllactinia taurica Bradshaw 2025) - Phylum Ascomycota, Order Helotiales, Family Erysiphaceae - between 1851 and 2023doi:10.15468/f8bb95 | Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) | CC BY 4.0 | 32 |
| Mycological collection of the United Herbaria of the University and ETH Zurich (Z+ZT)doi:10.15468/8dyyr8 | United Herbaria of the University and ETH Zurich (Z+ZT) | CC BY 4.0 | 19 |
| The Erysiphales Collection at the Botanische Staatssammlung Münchendoi:10.15468/sookye | Staatliche Naturwissenschaftliche Sammlungen Bayerns | CC BY 4.0 | 13 |
| CABI Bioscience Genetic Resource Collectiondoi:10.15468/yr757j | CABI (Centre for Agriculture and Biosciences International) | CC BY 4.0 | 10 |
| USDA United States National Fungus Collectionsdoi:10.15468/w78rwb | USDA-ARS US National Fungus Collection | CC0 1.0 | 9 |
| Meise Botanic Garden Herbarium (BR)doi:10.15468/wrthhx | Meise Botanic Garden | CC BY 4.0 | 8 |
| Mushroom Observerdoi:10.15468/wwcmna | Mushroom Observer, Inc. | CC BY-NC 4.0 | 7 |
| Natural History Museum (London) Collection Specimensdoi:10.5519/qd.6xds2wew | Natural History Museum | CC0 1.0 | 5 |
| Fungal Biodiversity Centre (CBS) - Fungi strainsdoi:10.15468/giuq7w | Westerdijk Fungal Biodiversity Institute | CC0 1.0 | 5 |
| Herbarium Senckenbergianum (FR) - Fungidoi:10.15468/0oaq5v | Senckenberg | CC BY 4.0 | 4 |
| The New York Botanical Garden Herbarium (NY)doi:10.15468/6e8nje | The New York Botanical Garden | CC0 1.0 | 4 |
| Charles Gardner Shaw Mycological Herbarium, Washington State Universitydoi:10.15468/uz8hza | Charles Gardner Shaw Mycological Herbarium, Washington State University | CC BY-NC 4.0 | 4 |
| Fungi - Herbarium of The National Natural History Collectionsdoi:10.15468/q88hjy | The National Natural History Collections | CC BY-NC 4.0 | 4 |
| University of Tartu Natural History Museum and Botanical Garden DNA and Environmental Sample Collectionsdoi:10.15468/ed3ukm | University of Tartu, Natural History Museum and Botanical Garden | CC BY 4.0 | 3 |
| University of Colorado, Museum of Natural History Herbarium Lichen Collectiondoi:10.15468/llbjll | University of Colorado Museum of Natural History | CC BY-NC 4.0 | 3 |
| EUKARYOME: the rRNA gene reference database for identification of eukaryotesdoi:10.15468/ehkbkt | PlutoF | CC BY 4.0 | 3 |
| Canadian National Mycological Herbariumdoi:10.15468/dchmcy | Agriculture and Agri-Food Canada | CC BY 4.0 | 3 |
| New Zealand Fungal and Plant Disease Collection (PDD)doi:10.15468/nrq12b | Landcare Research | CC BY 4.0 | 3 |
| University of Tartu Natural History Museum and Botanical Garden Mycological Collectionsdoi:10.15468/d59dmk | University of Tartu, Natural History Museum and Botanical Garden | CC BY 4.0 | 2 |
| Wisconsin State Herbarium, Lichensdoi:10.15468/p4xh7g | University of Wisconsin - Madison | CC BY-NC 4.0 | 2 |
| The cryptogamy collection (PC) at the Herbarium of the Muséum national d'Histoire Naturelle (MNHN - Paris)doi:10.15468/mywiem | MNHN - Museum national d'Histoire naturelle | CC BY 4.0 | 2 |
| Botany (UPS)doi:10.15468/ufmslw | Museum of Evolution, Uppsala University | CC0 1.0 | 2 |
| Mycology herbarium, UiBdoi:10.15468/thx1nm | University of Bergen | CC BY 4.0 | 2 |
| WRSL Mycological Collectiondoi:10.15468/baz59x | University of Wrocław | CC BY-NC 4.0 | 2 |
| Field Museum of Natural History (Botany) Fungi Collectiondoi:10.15468/x2hjnp | Field Museum | CC0 1.0 | 2 |
| Bell Museum fungidoi:10.15468/ewjq2a | University of Minnesota Bell Museum | CC0 1.0 | 2 |
| Herbarium UGDA - Lichens Collection UGDA-Ldoi:10.15468/8wswxe | University of Gdańsk | CC BY 4.0 | 1 |
| L. IS dataset. Cyanoprocaryota, Lichens, Bryophytedoi:10.15468/ccjgny | L. | CC BY 4.0 | 1 |
| Bell Museum lichensdoi:10.15468/up3htf | University of Minnesota Bell Museum | CC0 1.0 | 1 |
| NABU|naturguckerdoi:10.15468/uc1apo | naturgucker.de | CC BY 4.0 | 1 |
| The University and Jepson Herbaria -- Lichendoi:10.15468/w3heee | Berkeley Natural History Museums | CC BY-NC 4.0 | 1 |
| Lichen specimens of National Museum of Nature and Science (TNS)doi:10.15468/huup8a | National Museum of Nature and Science, Japan | CC BY 4.0 | 1 |
| Lichens at Herbarium Berolinense, Berlin (B)doi:10.15468/gmyyyu | Botanic Garden and Botanical Museum Berlin | CC0 1.0 | 1 |
| Arizona State University Lichen Herbariumdoi:10.15468/qrwfjc | Arizona State University Biocollections | CC BY-NC 4.0 | 1 |
| Lund University Biological Museum - Botanical collection (LD)doi:10.15468/c4w4co | Lund University Biological Museum | CC BY-NC 4.0 | 1 |
| Field Museum of Natural History (Botany) Lichen Collectiondoi:10.15468/sc258x | Field Museum | CC0 1.0 | 1 |
| Nezahat Gökyiğit Botanic Garden (NGBB) Herbarium Specimensdoi:10.15468/rc9n6q | Nezahat Gökyiğit Botanic Garden | CC0 1.0 | 1 |
| BCCM/MUCL - Agro-food & Environmental Fungal Collectiondoi:10.15468/7pqccg | BCCM - Belgian Coordinated Collections of Micro-organisms | CC BY 4.0 | 1 |
| BCCM/IHEM - Fungi Collection: Human & Animal Healthdoi:10.15468/1s5hbg | BCCM - Belgian Coordinated Collections of Micro-organisms | CC BY 4.0 | 1 |
| PlutoF platform reference-based occurrencesdoi:10.15468/e15jve | PlutoF | CC BY 4.0 | 1 |
| Österreichische Mykologische Gesellschaft - Austrian Mycological Society Herbariumdoi:10.15468/wang2b | University of Vienna - Herbarium WU | CC BY 4.0 | 1 |
| Cornell University Plant Pathology Herbariumdoi:10.15468/xzn5g5 | Cornell Plant Pathology Herbarium (CUP) | CC0 1.0 | 1 |
| The Erysiphales Collection at the University Halle-Wittenbergdoi:10.15468/gccftu | Staatliche Naturwissenschaftliche Sammlungen Bayerns | CC BY 4.0 | 1 |
| University of Nebraska State Museum, C.E. Bessey Herbarium - Fungidoi:10.15468/j9s93a | University of Nebraska State Museum | CC BY-NC 4.0 | 1 |
| Herbarium GB, University of Gothenburgdoi:10.15468/asgd85 | University of Gothenburg | CC0 1.0 | 1 |