Hakkında

Türkiye Biyoçeşitlilik, Türkiye'de kaydedilmiş canlı türlerini açık veri kaynaklarından derleyerek Türkçe sunan bağımsız bir başvuru sitesidir. İlk bölüm mantarlardır; hayvanlar ve bitkiler hazırlanmaktadır.

Verinin kaynağı

Tür listesi ve kayıtlar GBIF'ten (Küresel Biyoçeşitlilik Bilgi Sistemi) alınır. GBIF; müzelerin, herbaryum ve fungaryumların, araştırma projelerinin ve iNaturalist gibi yurttaş bilimi platformlarının kayıtlarını ortak bir biçimde yayımlar. Sitede, ülke alanı Türkiye olan ve mantarlar âlemine (Fungi) ait 40 tür ile bu türleri içeren 88 üst takson yer alır. Sınıflandırma GBIF omurgasını (GBIF Backbone Taxonomy) izler; dünyadaki tür sayıları da bu omurgadaki kabul görmüş türlerdir.

Fiziksel kanıt ve çevresel DNA

Türkiye'deki mantar kayıtlarının büyük bölümü çevresel DNA (eDNA) çalışmalarından gelir: toprak, kök, su ya da hava örneklerinden çıkarılan DNA dizileri, başvuru veri tabanlarıyla karşılaştırılarak türlere atanır. Bu kayıtlar bir türün o ortamda bulunduğunu gösterir, ancak mantarın kendisi görülmemiş ya da toplanmamıştır; atama, başvuru dizilerinin doğruluğuna ve kapsamına bağlıdır.

Bu nedenle sitede kayıtlar iki gruba ayrılır ve her sayı, harita ve grafikte ayrı gösterilir:

  • Fiziksel kanıt: insan gözlemi, korunmuş fungaryum ve herbaryum örneği, kültür koleksiyonundaki canlı örnek, yayın (literatür) kaydı ve diğer gözlem türleri.
  • Çevresel DNA: GBIF'te kayıt temeli “materyal örneği” (MATERIAL_SAMPLE) olan kayıtlar.

Türlerin aylara göre dağılımı, rakım, il listeleri ve fotoğraflar yalnızca fiziksel kanıta dayanır. Haritalarda dolu noktalar fiziksel kayıtları, içi boş noktalar DNA örneklerini gösterir.

Sayılar nasıl hesaplanır

Kayıt sayıları, il, yıl ve ay dağılımları GBIF arama hizmetinin toplam sayımlarından alınır ve tüm kayıtları kapsar. Rakım, ilçe, habitat notu, toplayıcı ve gözlemci bilgileri ise her tür için ayrıntılı olarak indirilen en fazla 300 fiziksel kayda dayanır; çok kaydı olan türlerde bu bilgiler örneklem niteliğindedir. İl eşlemesi GBIF'in GADM sınırlarına göre yaptığı coğrafi kodlamayı izler. Üst taksonların sayıları, Türkiye'den kaydı bulunan türlerinin toplamıdır.

Şu anda toplam 13.967 kaydın 13.012'si çevresel DNA, 955'i fiziksel kanıt kaynaklıdır.

Türkçe adlar, görseller ve metinler

Türkçe adlar şu öncelikle seçilir: editörlerin kaynaklara dayanarak yazdığı içerik, kaynakları belirtilmiş Türkçe ad listesi ve Wikidata'daki Türkçe etiket ve yaygın adlar. Yöresel adlar bölgesi ve kaynağıyla birlikte gösterilir. Şu anda 2 türün Türkçe adı vardır; adı bilinmeyen türlerde yalnızca bilimsel ad kullanılır.

Görseller Wikimedia Commons'tan ve GBIF'e aktarılmış, açık lisanslı kayıt fotoğraflarından (çoğunlukla iNaturalist) alınır; her görselde fotoğrafçı, lisans ve kaynak bağlantısı belirtilir. 11 türün en az bir görseli vardır. Görseli olmayan taksonlarda bilimsel adın baş harfleri gösterilir.

Tür ve üst takson sayfalarındaki “Genel bakış” metinleri, editör içeriği bulunmayan sayfalarda verilerden otomatik olarak derlenir: her cümle bir veri alanına dayanır, veri yoksa cümle kurulmaz. Editör içeriği olan sayfalarda (28 sayfa) metin kaynakçasıyla birlikte verilir; denetimden geçmemiş metinler “Taslak” etiketi taşır. Vikipedi alıntıları (CC BY-SA) madde bağlantısıyla gösterilir; Türkçe madde yoksa İngilizce madde çevrilmeden ve açıkça belirtilerek verilir.

Morfoloji, ekoloji ve yenilebilirlik bilgileri Wikidata'daki mikomorfoloji özelliklerinden alınır ve Türkçeleştirilir; karşılığı bulunmayan değerler İngilizce özgün etiketiyle gösterilir.

Sınırlılıklar

  • GBIF'teki kayıtlar Türkiye'nin mantar çeşitliliğinin yalnızca belgelenmiş bir bölümünü yansıtır. Bir türün bir ilde kaydının olmaması, orada bulunmadığı anlamına gelmez; kayıt yoğunluğu çoğunlukla gözlemci ve araştırma yoğunluğunu gösterir.
  • Kayıtlardaki tür tanımları doğrulanmamış olabilir; özellikle yalnızca fotoğrafla yapılan gözlemlerde ve DNA atamalarında yanlış tanım olasılığı vardır.
  • Taksonomi sürekli değişir. Sitede GBIF omurgasındaki kabul görmüş adlar kullanılır; güncel adlandırma için Index Fungorum ve MycoBank bağlantılarına bakılmalıdır.
  • Otomatik derlenen metinler yalnızca verideki bilgiyi aktarır; türün biyolojisine ilişkin uzman değerlendirmesi yerine geçmez.

Yenilebilirlik uyarısı

Sitedeki yenilebilirlik bilgileri yalnızca bilgilendirme amaçlıdır. Bu siteye dayanarak hiçbir mantar toplanmamalı ya da yenmemelidir. Zehirlenme şüphesinde 114 Ulusal Zehir Danışma Merkezi'ni (UZEM) arayın. Ayrıntılar: Mantar zehirlenmeleri.

Veri setleri ve lisanslar

Kayıtların geldiği 53 GBIF veri seti aşağıda listelenmiştir. Veri setleri CC0, CC BY ya da CC BY-NC lisanslıdır; atıf için veri seti sayfasındaki DOI kullanılmalıdır. İl sınırları geoBoundaries (OpenStreetMap katkıcıları, CC BY-SA 2.0) verisinden sadeleştirilmiştir.

Kayıtların geldiği GBIF veri setleri
Veri setiYayımlayanLisansKayıt
Global soil organismsdoi:10.15468/fdpeawPlutoFCC0 1.011.205
INSDC Host Organism Sequencesdoi:10.15468/e97kmyEuropean Nucleotide Archive (EMBL-EBI)CC BY 4.01.042
INSDC Sequencesdoi:10.15468/sbmztxEuropean Nucleotide Archive (EMBL-EBI)CC BY 4.0571
iNaturalist Research-grade Observationsdoi:10.15468/ab3s5xiNaturalist.orgCC BY-NC 4.0456
International Barcode of Life project (iBOL)doi:10.15468/inygc6The International Barcode of Life ConsortiumCC BY 4.0196
CABI Bioscience Fungus Collectiondoi:10.15468/c9vdlfCABI (Centre for Agriculture and Biosciences International)CC BY 4.0161
Royal Botanic Gardens, Kew - Fungarium Specimensdoi:10.15468/ngrz4bRoyal Botanic Gardens, KewCC BY 4.0119
Global soil microbiomes: A new frontline of biome-ecology researchdoi:10.1111/geb.13487PlutoFCC BY 4.043
Global occurrence database of Leveillula taurica (Lév.) Arnaud 1921 (synonym: Erysiphe taurica Léveillé 1851, Phyllactinia taurica Bradshaw 2025) - Phylum Ascomycota, Order Helotiales, Family Erysiphaceae - between 1851 and 2023doi:10.15468/f8bb95Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE)CC BY 4.032
Mycological collection of the United Herbaria of the University and ETH Zurich (Z+ZT)doi:10.15468/8dyyr8United Herbaria of the University and ETH Zurich (Z+ZT)CC BY 4.019
The Erysiphales Collection at the Botanische Staatssammlung Münchendoi:10.15468/sookyeStaatliche Naturwissenschaftliche Sammlungen BayernsCC BY 4.013
CABI Bioscience Genetic Resource Collectiondoi:10.15468/yr757jCABI (Centre for Agriculture and Biosciences International)CC BY 4.010
USDA United States National Fungus Collectionsdoi:10.15468/w78rwbUSDA-ARS US National Fungus CollectionCC0 1.09
Meise Botanic Garden Herbarium (BR)doi:10.15468/wrthhxMeise Botanic GardenCC BY 4.08
Mushroom Observerdoi:10.15468/wwcmnaMushroom Observer, Inc.CC BY-NC 4.07
Natural History Museum (London) Collection Specimensdoi:10.5519/qd.6xds2wewNatural History MuseumCC0 1.05
Fungal Biodiversity Centre (CBS) - Fungi strainsdoi:10.15468/giuq7wWesterdijk Fungal Biodiversity InstituteCC0 1.05
Herbarium Senckenbergianum (FR) - Fungidoi:10.15468/0oaq5vSenckenbergCC BY 4.04
The New York Botanical Garden Herbarium (NY)doi:10.15468/6e8njeThe New York Botanical GardenCC0 1.04
Charles Gardner Shaw Mycological Herbarium, Washington State Universitydoi:10.15468/uz8hzaCharles Gardner Shaw Mycological Herbarium, Washington State UniversityCC BY-NC 4.04
Fungi - Herbarium of The National Natural History Collectionsdoi:10.15468/q88hjyThe National Natural History CollectionsCC BY-NC 4.04
University of Tartu Natural History Museum and Botanical Garden DNA and Environmental Sample Collectionsdoi:10.15468/ed3ukmUniversity of Tartu, Natural History Museum and Botanical GardenCC BY 4.03
University of Colorado, Museum of Natural History Herbarium Lichen Collectiondoi:10.15468/llbjllUniversity of Colorado Museum of Natural HistoryCC BY-NC 4.03
EUKARYOME: the rRNA gene reference database for identification of eukaryotesdoi:10.15468/ehkbktPlutoFCC BY 4.03
Canadian National Mycological Herbariumdoi:10.15468/dchmcyAgriculture and Agri-Food CanadaCC BY 4.03
New Zealand Fungal and Plant Disease Collection (PDD)doi:10.15468/nrq12bLandcare ResearchCC BY 4.03
University of Tartu Natural History Museum and Botanical Garden Mycological Collectionsdoi:10.15468/d59dmkUniversity of Tartu, Natural History Museum and Botanical GardenCC BY 4.02
Wisconsin State Herbarium, Lichensdoi:10.15468/p4xh7gUniversity of Wisconsin - MadisonCC BY-NC 4.02
The cryptogamy collection (PC) at the Herbarium of the Muséum national d'Histoire Naturelle (MNHN - Paris)doi:10.15468/mywiemMNHN - Museum national d'Histoire naturelleCC BY 4.02
Botany (UPS)doi:10.15468/ufmslwMuseum of Evolution, Uppsala UniversityCC0 1.02
Mycology herbarium, UiBdoi:10.15468/thx1nmUniversity of BergenCC BY 4.02
WRSL Mycological Collectiondoi:10.15468/baz59xUniversity of WrocławCC BY-NC 4.02
Field Museum of Natural History (Botany) Fungi Collectiondoi:10.15468/x2hjnpField MuseumCC0 1.02
Bell Museum fungidoi:10.15468/ewjq2aUniversity of Minnesota Bell MuseumCC0 1.02
Herbarium UGDA - Lichens Collection UGDA-Ldoi:10.15468/8wswxeUniversity of GdańskCC BY 4.01
L. IS dataset. Cyanoprocaryota, Lichens, Bryophytedoi:10.15468/ccjgnyL.CC BY 4.01
Bell Museum lichensdoi:10.15468/up3htfUniversity of Minnesota Bell MuseumCC0 1.01
NABU|naturguckerdoi:10.15468/uc1aponaturgucker.deCC BY 4.01
The University and Jepson Herbaria -- Lichendoi:10.15468/w3heeeBerkeley Natural History MuseumsCC BY-NC 4.01
Lichen specimens of National Museum of Nature and Science (TNS)doi:10.15468/huup8aNational Museum of Nature and Science, JapanCC BY 4.01
Lichens at Herbarium Berolinense, Berlin (B)doi:10.15468/gmyyyuBotanic Garden and Botanical Museum BerlinCC0 1.01
Arizona State University Lichen Herbariumdoi:10.15468/qrwfjcArizona State University BiocollectionsCC BY-NC 4.01
Lund University Biological Museum - Botanical collection (LD)doi:10.15468/c4w4coLund University Biological MuseumCC BY-NC 4.01
Field Museum of Natural History (Botany) Lichen Collectiondoi:10.15468/sc258xField MuseumCC0 1.01
Nezahat Gökyiğit Botanic Garden (NGBB) Herbarium Specimensdoi:10.15468/rc9n6qNezahat Gökyiğit Botanic GardenCC0 1.01
BCCM/MUCL - Agro-food & Environmental Fungal Collectiondoi:10.15468/7pqccgBCCM - Belgian Coordinated Collections of Micro-organismsCC BY 4.01
BCCM/IHEM - Fungi Collection: Human & Animal Healthdoi:10.15468/1s5hbgBCCM - Belgian Coordinated Collections of Micro-organismsCC BY 4.01
PlutoF platform reference-based occurrencesdoi:10.15468/e15jvePlutoFCC BY 4.01
Österreichische Mykologische Gesellschaft - Austrian Mycological Society Herbariumdoi:10.15468/wang2bUniversity of Vienna - Herbarium WUCC BY 4.01
Cornell University Plant Pathology Herbariumdoi:10.15468/xzn5g5Cornell Plant Pathology Herbarium (CUP)CC0 1.01
The Erysiphales Collection at the University Halle-Wittenbergdoi:10.15468/gccftuStaatliche Naturwissenschaftliche Sammlungen BayernsCC BY 4.01
University of Nebraska State Museum, C.E. Bessey Herbarium - Fungidoi:10.15468/j9s93aUniversity of Nebraska State MuseumCC BY-NC 4.01
Herbarium GB, University of Gothenburgdoi:10.15468/asgd85University of GothenburgCC0 1.01